，为武帝所采纳，使儒学成为中华文化的社会基础，影响长达二千多年。

董仲舒的弟子很多，他讲学的方法是「下帷讲诵」，讲课时用幕布围起来，只教高才生，一般学生则由高才生去教，因此很多董派弟子根本没见过董仲舒本人。他的弟子有出色的，褚大为梁相，嬴公为谏大夫，吕步舒为丞相长史。

董仲舒居家写《灾异之记》，当时辽东高庙发生了火灾，主父偃把书上奏给了汉武帝。汉武帝让学者讨论，以为该书讥讽朝政。

董仲舒的学生吕步舒当时也在场，他不知这是老师的作品，批评此书是「大愚！」。结果，董仲舒被判死罪。后来被汉武帝赦免。被废为中大夫。以后董仲舒再也不敢宣传「阴阳灾异」了，晚年「居家以修学着书为事」。

董仲舒其学以儒家宗法思想为中心，建议以「弱枝」或「小末」的方式严禁王侯大臣擅权，杂以阴阳五行说，把神权、君权、父权、夫权贯串在一起，形成帝制神学体系，流行於汉代的谶纬都是继承了董仲舒的感应、灾异之说。

董仲舒还把《公羊春秋》用於司法上，提出「《公羊》治狱」，即《公羊董仲舒治狱》，是汉代酷吏产生的基础。从而他提出了天人感应、三纲五常等重要儒家理论。

董仲舒有一百多篇文章、词赋传世，但是今日除了《天人三策》、《士不遇赋》之外大多散佚。

《隋书、经籍志》所着录《春秋繁露》据说是董仲舒作品，这个说法暂时为学界所接受；由於该书内容杂芜不纯，无法完全证实是董氏之主张。

皮锡瑞称：「董子传《公羊》，《春秋繁露》所载，皆言经义，且皆与《公羊传》合。是董子之於经学，尤为专门名家。」
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